Typy přírodních stanovišť, pro která byla vyhlášena EVL Lanškrounské rybníky, a která se nacházejí v území přírodní rezervace - bezkolencové louky na vápnitých, rašelinných nebo hlinito-jílovitých půdách (Molinion caeruleae) a smíšené jasanovo-olšové lužní lesy temperátní a boreální Evropy (Alno-Padion, Alnion incanae, Salicion albae).