Za národní přírodní památku se vyhlašuje přírodní útvar určený k ochraně
a) lesních ekosystémů lužních lesů a dubohabřin,
b) travinobylinných ekosystémů luk a pastvin a suchých trávníků,
c) vodních a mokřadních ekosystémů makrofytní vegetace vodních toků a makrofytní vegetace přirozeně eutrofních a mezotrofních stojatých vod a vegetace jednoletých vlhkomilných bylin,
d) biotopů vzácných a ohrožených druhů živočichů tesaříka obrovského (
Cerambyx cerdo), roháče obecného (
Lucanus cervus), krasce dubového (
Eurythyrea quercus), rýhovce (
Omoglymmius germari), piskoře pruhovaného (
Misgurnus fossilis), čolka dunajského (
Triturus dobrogicus), kuňky ohnivé (
Bombina bombina) a chřástala polního (
Crex crex), včetně jejich populací,
e) biotopů vzácných a ohrožených druhů rostlin bledule letní (
Leucojum aestivum), pryšce lesklého (
Euphorbia lucida) a řeřišnice malokvěté (
Cardamine parviflora), včetně jejich populací,
f) části říční nivy na soutoku řek Moravy a Dyje, včetně její přirozené dynamiky záplav,
g) typů přírodních stanovišť a druhů, které jsou předmětem ochrany Evropsky významné lokality Soutok-Podluží
1) a Ptačí oblasti Soutok-Tvrdonicko
2), které se nacházejí na území národní přírodní památky.