Předmětem ochrany jsou: a) harmonicky utvářená krasová krajina s typickým krajinným rázem daným zejména reliéfem krasových plošin, hlubokých krasových kaňonů (žlebů), včetně jejích kulturních a historických složek, b) jedinečný soubor povrchových a podzemních krasových jevů ve všech fázích jejich vývoje, včetně jeskyní s jejich výplněmi, c) historická důlní díla, d) specifická společenstva podzemních prostor s výskytem vzácných a zvláště chráněných druhů živočichů, e) povrchové a podzemní vodní toky, vodní plochy a mokřady s přirozeným vodním režimem, přirozenou morfologií, hydrologickými funkcemi a na ně vázanou biotou, f) přirozená a přírodě blízká lesní a nelesní společenstva s vysokou druhovou pestrostí a g) předměty ochrany evropsky významné lokality Moravský kras.
