Flóra:
V území se vyskytuje přes 300 druhů cévnatých rostlin. Ze zajímavějších např. masožravá bublinatka jižní,blatěnka vodní, šípatka střelolistá, stolístek klasnatý, ostřice nedošáchor, ostřice Otrubova nebo šáchor hnědý. Problematické jsou nepůvodní, potencionálně expanzivní druhy jako javor jasanolistý a zlatobýl (celík) kanadský.
Fauna:
Velká hnízdní kolonie (několik tisíc párů) racka chechtavého na větším ostrově. Zde také každoročně hnízdí několik párů racka černohlavého. Z dalších hnízdících ptáků např. potápka roháč, žluva hajní, moudivláček lužní z protahujících ptáků např. kormorán velký, hvízdák euroasijský, hohol severní, volavka bílá nebo rybák černý. Obojživelníci: skokan skřehotavý, skokan
zelený, skokan štíhlý, čolek obecný, ropucha obecná či rosnička zelená. Stabilně se tu vyskytuje populace bobra evropského.
Neživá příroda:
Geologické podloží tvoří kvartérní štěrkové sedimenty řeky Moravy, které byly do roku 1977 předmětem těžby. Jádrem území je jezero vzniklé těžbou štěrkopísku.
Omezení:
Kvůli vyrušování zde hnízdících ptáků je na Chomoutovském jezeře zakázáno koupání a další vodní sporty (využívajících různých plavidel). Vyjma těch, kteří získali odůvodněnou výjimku z tohoto zákazu. Koupání není zakázáno na blízkém jezeře Poděbrady. Území trpí rovněž velkým množstvím nelegálních skládek, které jsou zde zakázány.
Péče:
Na části přírodní památky byly vybudovány nové mokřady s tůněmi. Pro návštěvníky zde byla zřízena ptačí pozorovatelna.
